MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022784	CCG	2	6	259860	259865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_022784	AGT	2	6	259886	259891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022784	GCT	2	6	259910	259915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_022784	GCCCG	2	10	259966	259975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1505	NC_022784	TG	3	6	260005	260010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_022784	TGG	2	6	260023	260028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_022784	TGG	2	6	265776	265781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022784	GTG	2	6	265782	265787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022784	TGT	2	6	265862	265867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022784	GT	3	6	265941	265946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_022784	GGT	2	6	265971	265976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_022784	TGCG	2	8	266013	266020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_022784	AGC	2	6	266066	266071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_022784	TCA	2	6	266122	266127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_022784	CTG	2	6	268227	268232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_022784	CT	3	6	268299	268304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_022784	TAA	2	6	268319	268324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022784	GTAA	2	8	269337	269344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022784	TTC	2	6	269360	269365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022784	AAT	2	6	269370	269375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022784	CGTG	2	8	269616	269623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_022784	GCAC	2	8	270685	270692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_022784	TAC	2	6	270761	270766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_022784	ACT	2	6	270803	270808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_022784	TCC	2	6	270842	270847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_022784	ATATT	2	10	270882	270891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_022784	TTC	2	6	270899	270904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_022784	TGT	2	6	272252	272257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_022784	TTG	2	6	272308	272313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_022784	AT	3	6	272328	272333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022784	GGT	2	6	272365	272370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_022784	GAT	3	9	274987	274995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022784	TAC	2	6	275007	275012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_022784	ATC	2	6	275062	275067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022784	A	7	7	275068	275074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022784	TGC	2	6	275132	275137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022784	CAC	2	6	276231	276236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_022784	CA	3	6	276245	276250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_022784	TCC	2	6	276376	276381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_022784	GC	3	6	276387	276392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_022784	GCG	2	6	276437	276442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_022784	ATCT	2	8	277751	277758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_022784	C	6	6	280644	280649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1544	NC_022784	N	757	757	280863	281619	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022784	AGG	2	6	281681	281686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_022784	GA	3	6	281744	281749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_022784	T	6	6	281754	281759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022784	CCA	2	6	281767	281772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_022784	TTG	2	6	281815	281820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022784	TTCA	2	8	281986	281993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_022784	GTT	2	6	282261	282266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022784	GGA	2	6	282333	282338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022784	ATA	2	6	282358	282363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_022784	CAG	2	6	282438	282443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_022784	G	11	11	282446	282456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_022784	TCA	2	6	282464	282469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_022784	C	6	6	282493	282498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1558	NC_022784	CG	3	6	282500	282505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_022784	T	6	6	282520	282525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022784	AGA	2	6	282601	282606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022784	CTG	2	6	284585	284590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_022784	TGGGCT	2	12	284623	284634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1563	NC_022784	CTG	2	6	284791	284796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_022784	TTG	2	6	284837	284842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022784	ATCC	2	8	284846	284853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_022784	CCT	2	6	284855	284860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_022784	CTTT	2	8	284867	284874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_022784	CA	3	6	284884	284889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_022784	CTTG	2	8	286114	286121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_022784	GAC	2	6	286131	286136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_022784	TCC	2	6	286176	286181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_022784	CCA	2	6	286209	286214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_022784	TGT	2	6	287277	287282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022784	CG	3	6	287304	287309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_022784	GTT	2	6	287338	287343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022784	GCA	2	6	287407	287412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_022784	ATGT	2	8	288898	288905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_022784	AT	3	6	288912	288917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_022784	CCT	2	6	288942	288947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_022784	CCA	2	6	289553	289558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_022784	CTC	2	6	289573	289578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_022784	A	6	6	289622	289627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_022784	CA	3	6	289698	289703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_022784	CG	3	6	289714	289719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_022784	AGC	2	6	289764	289769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_022784	CCTA	2	8	289823	289830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_022784	TTC	2	6	289836	289841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_022784	AG	3	6	289887	289892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_022784	CAAC	2	8	289898	289905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_022784	G	6	6	290099	290104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_022784	TGA	2	6	291554	291559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_022784	GGC	2	6	291610	291615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_022784	TG	3	6	291665	291670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022784	TG	3	6	291770	291775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_022784	CAA	2	6	291814	291819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_022784	TG	3	6	291824	291829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022784	GT	3	6	292303	292308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_022784	AGTTG	2	10	292351	292360	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_022784	ATG	2	6	292366	292371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022784	TGA	2	6	292409	292414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_022784	CAC	2	6	292417	292422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_022784	TGT	2	6	292430	292435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_022784	GGA	2	6	292448	292453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_022784	TGG	2	6	292454	292459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_022784	GAGTT	2	10	292477	292486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_022784	TTGC	2	8	292515	292522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_022784	GAT	2	6	292571	292576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022784	TGT	2	6	292577	292582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_022784	CTG	2	6	292636	292641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_022784	AGG	2	6	292651	292656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_022784	CTT	2	6	292685	292690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_022784	GAT	2	6	292763	292768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022784	TG	3	6	292809	292814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022784	CG	3	6	292872	292877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_022784	CTT	2	6	292937	292942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_022784	GTA	2	6	293074	293079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_022784	TGG	2	6	293081	293086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_022784	TGG	2	6	293093	293098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_022784	N	639	639	293107	293745	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_022784	ATGA	2	8	293820	293827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022784	AGG	2	6	293853	293858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022784	TCA	2	6	293904	293909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_022784	CAG	2	6	293923	293928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_022784	TTGG	2	8	293933	293940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022784	TCC	2	6	293967	293972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_022784	CTG	2	6	294025	294030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_022784	TG	3	6	294029	294034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022784	TGG	4	12	294052	294063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022784	ACT	2	6	294071	294076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_022784	CTGTT	2	10	294105	294114	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_022784	GCA	2	6	294115	294120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_022784	TTTC	2	8	294121	294128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_022784	TCC	2	6	294144	294149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_022784	CAGG	2	8	294265	294272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_022784	TGA	2	6	294424	294429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_022784	TG	3	6	294436	294441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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